История города Григориополя начинается в XVIII веке, когда на берегах Днестра появились армяне. В 1784 году жители северного Кавказа просили российские власти предоставить им земли для поселения на правах иностранных колонистов. Просьбу армян частично, но выполнили. Началось создание колонии, затянувшееся на 8 лет. Прибывшие на место армянские поселенцы поначалу были разочарованны: земли были малоосвоенными и слабозаселёнными.
К югу от Днестра в селении Делакеу тогда проживали молдаване. На склонах балок в деревнях Черный и Казацкой Слободе проживали старообрядцы и казаки.
Здесь и повелела Екатерина II основать город Григориополь.
Существуют документы, свидетельствующие о двух версиях, в честь кого был назван город. По одному предписанию, князь Потёмкин повелел назвать новый город армян Григориополем «в честь ангела своего», а по другому предписанию: «повелел составить из селения их город во имя святого Григория Просветителя всея Армении».
Закладка состоялась 25 июля 1792 года. Участие в торжестве приняло большое количество людей и вельмож, в их числе был и правитель Екатеринославского наместничества Григорий Александрович Потёмкин. Губернатор лично нёс один из шести громадных камней, которые впоследствии были положены в основание города. Предназначался камень для закладки соборной церкви.
На территории города существовало две церкви: церковь Святой Богородицы и церковь Петра и Павла. Также в городе был свой магистрат. Григориополь был самоуправленческим: функционировали Третейский и Сиротский суды. В городе развивали земледелие, скотоводство, торговлю и ремесло. Также было пароходство, имелась пристань, где стояли несколько десятков судов. Изначально город был заложен как экономический торговый центр, и именно здесь проходил торговый путь.
В 1794 году Екатерина II подписала Указ о присвоении городу своего герба и печати.
Росла и численность населения. При основании города в нём проживали более 500 семей, а по данным переписи населения в 1797 году числилось более порядка 8 000 жителей. К тому времени Григориополь попал в немилость – император Павел переименовал его в город Черный, жителей лишили всех привилегий. Но это время было не долгим, и в 1801 году городу вернули привилегии и отменили страшное название.
12 октября 1924 года был образован Григориопольский район Молдавской АССР. Григориополь стал посёлком городского типа. В сёлах района живут люди разных национальностей: молдаване, русские, армяне, украинцы и многие другие.
В 1958 году в связи с укрупнением районов МССР район был расформирован и разделён между Дубоссарским и Тираспольским районами. Указом Президиума Верховного Совета МССР от 21 июня 1971 года Григориопольский район был воссоздан.
17 июня 2002 года Решением Верховного Совета Приднестровской Молдавской Республики Григориополю присвоен статус города.